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基于网络药理学及分子对接探讨丹红通精方治疗男性不育症的作用机制

Exploring Mechanism of Danhong Tongjing Formula in Treating Male Infertility Based on Network Pharmacology and Molecular Docking

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]广东省中医院珠海医院
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关键词: 丹红通精方 男性不育症 网络药理学 分子对接

摘要:
目的:基于网络药理学及分子对接探讨丹红通精方治疗男性不育症的作用机制。方法:基于中国知网、万方数据、中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)等数据库检索丹红通精方组方药物的主要有效成分,通过TCMSP检索有效成分相关靶点。运用Genecards、DisGeNET和在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)检索不育相关靶点。通过Venny 2.1软件对丹红通精方的有效活性成分靶点和丹红通精方靶点进行映射,筛选出共同靶点,即为丹红通精方治疗不育的潜在靶点,绘制韦恩图。将潜在靶点导入String数据库,得到潜在靶点的蛋白相互关系(protein-protein interaction, PPI),并构建PPI网络。将有效成分、潜在靶点导入Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-有效成分-潜在靶点-疾病”网络,并采用Network Analyzer进行拓扑分析筛选核心有效成分。运用R软件进行潜在靶点的基因本体(gene ontology, GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析。采用AutoDock Vina对关键成分和靶点进行分子对接。结果:通过检索各数据库获得丹红通精方有效成分264个,相关靶点313个。运用Genecards、DisGeNET和OMIM数据库获得不育相关靶点3 765个。通过Venny 2.1软件筛选出203个潜在靶点。“药物-有效成分-潜在靶点-疾病”网络拓扑分析筛选得到槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等核心成分。PPI网络分析得到JUN、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptors, PPARs)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、核转录因子-κB抑制剂α(nuclear transcription factor-κB inhibitor alpha, NF-κBIα)等核心靶点。KEGG信号通路富集分析得到157条信号通路。分子对接显示核心成分与核心蛋白结合良好。结论:丹红通精方中的槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等成分与JUN、PPARs、IL-6等蛋白通过调节IL-17、癌症中的蛋白聚糖、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)等信号通路降低睾丸局部炎症、改善氧化应激反应、微循环、提供精子生成所必需的营养物质,最终改善精液质量。

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第一作者机构: [1]广东省中医院珠海医院
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