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HCV反向点杂交基因分型方法的建立

HCV Genotyping by Reverse Dot Blot

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]广东省中医院珠海医院,珠海,519015 [2]中山大学达安基因诊断中心,广州,510080
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关键词: 丙型肝炎病毒 反向点杂交 基因分型

摘要:
目的 利用反向点杂交技术建立HCV基因分型新方法.方法 在HCV 5'端非编码区(5'NCR)设计引物和分型探针(1.2.3.6型),采用反向点杂交分型技术对53例HCV RNA阳性(浓度均在102~107 IU/mL之间)血清进行分型,并以基因序列分析作为金标准,对新方法的敏感性、特异性和重复性进行评价.结果 反向点杂交基因分型新方法检出的基因型有52例:1b型32例占60.38%,2a型4例占7.55%,6a型8例占15.09%.3b型8例占15.09%;未检出的基因型有1例,用基因序列分析也未能确定型别(失败的原因应是该HCV RNA扩增产物浓度偏低2.24×102IU/mL).本研究的方法敏感性为98.1%,特异性为100%,随机抽取20份标本再次检测的结果与前次检测的结果完全一致,重复性好.结论 相对现有的型特异性PCR分型、基因芯片、核酸序列分析等各种方法,反向点杂交技术用于HCV基因分型是一种准确有效和简便经济的方法.

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第一作者:
第一作者机构: [1]广东省中医院珠海医院,珠海,519015
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