资源类型：
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◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-C
文章类型：
机构：
[1]广东省中医院,广东,广州,510106
广东省中医院
[2]北京大学化学与分子工程学院,北京,1000871
[3]中国中医研究院西苑医院,北京,100091
出处：
ISSN：
关键词：
结合自由能
分子对接
评价函数
法尼酯受体
中草药
摘要：
以蛋白质晶体结构数据库PDB中FXR-fexaramine复合物(PDB代码:1OSH)三维结构为研究对象,采用Ligandfit作为采样工具,筛选到中草药中12个可能与FXR相互作用强的的配体.并比较了11种结合自由能评价函数(Ligscorel、Ligscore2、D-Score、-PLP1、-PLP2、Jain、-PMF、Ludi1、Ludi2、Ludi3,以及共同评价函数)在该研究体系中的预测能力.结果表明将评价函数中的-PLP1和-PLP1这2种评价函数的预测能力最好.
第一作者：
第一作者机构：
[1]广东省中医院,广东,广州,510106
推荐引用方式(GB/T 7714)：
朱伟,黄钦,李旭东,等.11种结合自由能评价函数对中草药中法尼酯受体的配体预测比较[J].计算机与应用化学.2007,24(1):94-96.
