[目的]比较系统性红斑狼疮(SLE)患者与正常人基因表达谱的改变,寻找SLE中医证候相关基因.[方法]采集静脉血5 mL提取总RNA后,反转录合成、标记cDNA探针,与基因芯片杂交后检测.对SLE患者热毒炽盛、阴虚内热型基因表达谱差异进行聚类分析.[结果]发现9例SLE患者与正常人比较均有显著性差异表达的基因89个,涉及细胞因子及受体相关基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白、蛋白翻译合成、凋亡相关基因等.两证型大部分基因表达具有一致性,但有明显的表达程度差异.聚类分析结果显示,4例热毒炽盛归为明显一类,5例阴虚内热型患者归为另一类.热毒炽盛型代谢相关基因、急性时相炎症反应相关基因表达水平明显高于阴虚内热型.[结论]SLE的发生是由多基因共同作用的结果,在不同的证候中基因表达水平可能不同;证候微观的生物学基础可能反映为多种非特异性指标的多种组合、变化模式,有待进一步增加样本量继续研究和验证.