资源类型：
收录情况：
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-C
文章类型：
机构：
[1]广州中医药大学第二临床医学院,广东广州510405
广东省中医院
[2]广州中医药大学第一临床医学院,广东广州510000
[3]广州中医药大学针灸康复学院,广东广州510405
[4]湖南中医药大学第一附属医院肿瘤科,湖南长沙410007
[5]广州中医药大学第一附属医院,广东广州510000
出处：
ISSN：
关键词：
基因芯片分析
原发性肝癌
微型核糖核酸
信使核糖核酸
摘要：
目的 筛选进展期原发性肝癌(HCC)相关靶基因.方法 从Gene Expressed Omnibus(GEO)数据库下载信使核糖核酸(mRNA)和微型核糖核酸(miRNA)表达谱.通过limma函数包分析得出差异表达mRNA、miRNA.基于FunRich软件对差异表达的miRNA进行转录因子富集分析.利用TargetScan筛选由差异表达miRNA调节的靶基因,并用Cytoscape软件构建miRNA-mRNA网络图.基于R软件对miRNA-mRNA进行联合基因本体(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集进行分析.结果 从进展期HCC样品中筛选出2382个差异表达mRNAs、213个差异表达miRNAs,对应的转录因子中以EGR1和SP1表达最为显著,miRNA-mRNA调控网络中具有较高节点度的基因为CPEB3、FERMT2.miRNA-mRNA富集于128个GO terms中,如蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性正调控等过程,通路主要富集在包括FoxO信号、MARK信号通路等.结论 Hsa-miR-614可能与进展期HCC关系密切,CPEB3、ALB可能是进展期HCC的潜在生物标志物.
基金：
国家自然科学基金资助项目(81873303),湖南省自然基金青年基金资助项目(2016JJ6113),湖南中医药大学中医学一流学科开放基金资助项目(2018ZYX51)
第一作者：
第一作者机构：
[1]广州中医药大学第二临床医学院,广东广州510405
通讯作者：
推荐引用方式(GB/T 7714)：
莫嘉浩,方彩珊,许洪彬,等.基于信使核糖核酸和微型核糖核酸芯片分析进展期肝癌靶基因[J].中国临床药理学杂志.2020,36(13):1837-1841.
