目的对比分析电磁导航引导经皮椎间孔镜下腰椎间盘切除术（see electromagnetic-navigation endoscopic spinal surgery system,SEESSYS）与C臂透视引导经皮椎间孔镜下腰椎间盘切除术（transforaminal endoscopic surgical system,TESSYS）的疗效,探讨电磁导航技术在椎间孔镜手术应用中的优势与不足。方法 2018年9-12月在我院接受经皮椎间孔镜手术治疗的44例腰椎间盘突出症患者,SEESSYS组和TESSYS组各22例。比较两组的手术时间（置管时间与镜下减压时间）、术中透视次数、住院天数。应用视觉模拟量表（VAS）评分、Oswestry残疾指数（ODI）和改良MacNab标准进行疗效评估。结果 SEESSYS组的置管时间、总手术时间和术中透视次数均明显短于TESSYS组（P (0.01）,而两组的镜下减压时间和住院天数差异无统计学意义（P) 0.05）。SEESSYS组和TESSYS组的术后ODI和VAS明显低于术前（P (0.01）,但两组之间各时间点的ODI和VAS评分差异无统计学意义（P) 0.05）。2年随访后,SEESSYS组的优良率是95.5%,TESSYS组为90.91%。结论相对于C臂透视引导,电磁导航经皮椎间孔镜手术2年随访的临床疗效明确,有助于减少术中X线辐射损害,也能有效缩短置管时间和总体手术时间,提高手术效率。