目的：通过分析河北邢台及云南瑞丽COVID-19患者中医证治的异同，探讨三因制宜理论在COVID-19防治中的指导价值，并对其在新突发传染病防治中的指导意义展开思考。方法：通过电子病历系统（HIS）回顾性收集两家医院COVID-19患者一般资料及中医四诊信息，获得中药处方信息，采用SPSS 18.0对一般信息及证候资料进行描述性统计；使用广东省中医院大数据智能处理与知识服务系统对中药进行频数统计及关联规则分析，并对症-药进行热图-层次聚类分析。结果：共纳入COVID-19患者175人，其中河北邢台70人，以中青年男性为主，临床多见发热、汗出异常、疲倦乏力等表现，主要病机为寒湿困表、郁热伤阴，“寒、湿、虚”征象明显，治疗上以宣表化湿为主，兼泻郁热，核心方药包括茯苓、杏仁、石膏、陈皮、藿香等。云南瑞丽105人，以青年女性为主，临床症状不明显，多为无症状或轻型，湿阻肺胃为其主要病机，“湿、热”征象明显，治疗上以健脾化湿，轻清宣肺为主，核心方药包括茯苓、白术、甘草、薏苡仁、桔梗、金银花、藿香等。结论：两地病例临床特征、中医证候特点及处方用药存在差异，与COVID-19发生的时间、地域及人群特征可能存在内在联系，三因制宜理论有助于理解其内在关联，并在临床论治中发挥理论指导作用。