目的 鉴定大黄牡丹汤治疗结肠癌的核心化合物和靶点，以及构建预后模型来评估患者的总体生存情况。方法 通过检索多个数据库筛选得到大黄牡丹汤治疗结肠癌的靶点；通过GO和KEGG富集分析探讨大黄牡丹汤治疗结肠癌的作用机制；在使用单因素Cox分析筛选出与生存相关的靶点后，使用LASSO回归构建预后模型，计算模型风险评分；KM生存分析和ROC曲线用以验证和评估模型的可靠性；构建蛋白互作（proteinproteininteraction,PPI）网络和疾病-药物-化合物-靶点网络以筛选出核心靶点；使用HPA免疫组化数据库和Image J软件对核心靶点进行蛋白表达的验证；分子对接和分子动力学以评估核心化合物和靶点的结合情况。结果 共筛选出22个大黄牡丹汤治疗结肠癌的靶点，其主要参与调控对酮、氧水平的反应等生物学过程，与胃泌素信号、DNA损伤应答通路有关。LASSO回归去除冗杂因素，对单因素Cox分析筛选出的5个基因（CHEK1、BIRC5、GSTM2、CCNB1、VEGFA）构建预后模型。疾病-药物-化合物-靶点网络共筛选出2个核心化合物：槲皮素和芦荟大黄素。PPI网络共筛选出4个核心靶点：CCNB1、MYC、CCND1、PCNA。将核心靶点和预后模型的基因取交集，得到核心的1个靶点：CCNB1。生存分析显示CCNB1在高低风险组之间具有显著性差异。免疫组化结果表明，CCNB1在正常组织和结肠癌组织中差异表达，其差异具有统计学意义（P＜0.01）。分子对接和分子动力学结果验证了芦荟大黄素、槲皮素和CCNB1具有稳定的结合能。结论 大黄牡丹汤治疗结肠癌发挥作用主要可能通过槲皮素、芦荟大黄素靶向CCNB1来实现，大黄牡丹汤治疗结肠癌的预后模型可以用于患者预后的评估，效能良好。