目的:对临床痰液和中段尿标本分离的SQ219和SQ220进行生物学特性、系统进化和临床意义分析。方法:观察菌株的培养特性及生理生化特征；用VITEK2全自动微生物鉴定和药敏分析仪及MALDI-TOF质谱仪鉴定细菌；利用相关软件对细菌16S rRNA和核心基因组作系统发育分析及基因组平均核苷酸一致性(ANI)分析。结果:SQ219和SQ220为革兰阴性杆菌，专性需氧，触酶和氧化酶阳性，无动力；在30℃、pH7和不含NaCl的培养基中生长最佳；SQ220可在血平板上产生黄色素但SQ219不产生；SQ219和SQ220对氨曲南、阿米卡星、妥布霉素、黏菌素耐药，与金黄杆菌属药敏表型一致。SQ219和SQ220总长分别为5.08 Mb和4.80 Mb，G+C含量分别为36.72%和36.36%，均预测到β-内酰胺类耐药基因( blaCGA)。16S rRNA系统发育分析表明SQ219、SQ220与啤酒神金黄杆菌DSM18014 T相似性最高，分别为98.93%和98.36%；核心基因组进化分析显示SQ219、SQ220与啤酒神金黄杆菌DSM18014 T的进化关系最近。然而，两株菌与啤酒神金黄杆菌DSM18014 T ANI值分别为92.49%和93.27%，低于95%原核生物种的阈值。 结论:根据16S rRNA和全基因组的同源性和系统发育分析，判断SQ219和SQ220为金黄杆菌新种，丰富了金黄杆菌的进化信息，为金黄杆菌属细菌新种的鉴定奠定了基础。