资源类型：
收录情况：
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-C
文章类型：
机构：
[1]广州中医药大学第二附属医院//广东省中医院检验医学部,广东广州510120
大德路总院
检验科
大德路总院检验科
广东省中医院
[2]广州万德基因医学科技有限公司,广东广州510535
[3]广州中医药大学顺德医院,广东佛山528000
出处：
ISSN：
关键词：
乳腺癌
长链非编码RNA
共表达基因
摘要：
[目的]筛选乳腺癌患者生存期相关差异表达长链非编码RNA(lncRNA)及其共表达基因,并验证其乳腺癌细胞中的表达情况.[方法]通过TCGA数据库筛选943例RNA-seq数据信息:(837例乳腺癌患者+106例正常对照),发现长非编码MAPT-AS1高表达,乳腺癌患者生存期更短.构建长非编码MAPT-AS1过表达和干扰质粒,将构建好的质粒转染乳腺癌细胞株T47D,并用嘌呤霉素筛选出稳定表达的T47D细胞株,通过RT-qPCR验证长非编码MAPT-AS1及其共表达基因的表达情况.[结果]荧光显微镜观察及RT-qPCR验证,成功构建长非编码MAPT-AS1过表达及干扰稳定转染乳腺癌细胞株T47D,并筛选出干扰效率最高的长非编码MAPT-AS1干扰片段shRNA3.验证其共表达基因得到MAPT、MAPT-IT1和NXNL2在转染了干扰片段shRNA3后表达量降低,与长非编码MAPT-AS1的表达趋势一致.[结论]成功构建长非编码MAPT-AS1过表达及干扰稳定转染乳腺癌细胞株T47D,验证其和共表达基因表达情况与数据库一致,为进一步研究长非编码MAPT-AS1基因在乳腺癌中的作用机制奠定基础.
基金：
广东省科技计划项目(2014A020212274);广州市科技计划项目(201510010044);广东省中医院科技专项(YN2016QJ10)
基金编号：
2014A020212274
第一作者：
第一作者机构：
[1]广州中医药大学第二附属医院//广东省中医院检验医学部,广东广州510120
通讯作者：
推荐引用方式(GB/T 7714)：
许家瑞,刘冬冬,李贝贝,等.乳腺癌生存期相关长非编码MAPT-AS1及其共表达基因筛选与验证[J].中山大学学报(医学版).2019,40(03):467-472.
