资源类型:
收录情况:
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
文章类型:
机构:
[1]广东省中医院检验医学部 501180
大德路总院
检验科
大德路总院检验科
广东省中医院
[2]广州中医药大学第二临床医学院
广东省中医院
[3]南方医科大学附属何贤纪念医院检验科
出处:
ISSN:
关键词:
RNA
长链非编码
树突细胞
脂多糖类
CD48抗原
计算生物学
N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯
长链非编码RNA CD48-AS
摘要:
目的 筛选并阐明长链非编码RNA(lncRNA)CD48-AS与其反义互补分子CD48 mRNA在N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯(3-O-C12-HSL)阻碍人单核细胞诱导的树突状细胞(Mo-DCs)成熟过程中发挥作用的机制.方法 从健康人外周血中分离Mo-DCs,将未成熟的Mo-DCs细胞分为阴性对照组(0.1%DMSO)、脂多糖(LPS)阳性对照组(100μg/L的LPS)和实验组(100μg/L LPS+40μmol/L 3-O-C12-HSL)进行lncRNA芯片检测.筛选lncRNA表达谱中差异表达5倍以上的自然反义lncRNA进行聚类分析,从中筛选差异具有统计学意义的自然反义lncRNA CD48-AS.未成熟的Mo-DCs分为阴性对照组、LPS阳性对照组以及LPS+C5、C10、C25实验组(分别加入5、10、25μmol/L的3-O-C12-HSL).利用荧光定量PCR检测lncRNA CD48-AS和反义分子CD48 mRNA在实验体系中的表达水平;通过生物信息学分析lncRNA CD48-AS与CD48反义互补区及其蛋白编码功能;通过核糖核酸酶保护实验(RPA)验证lncRNA CD48-AS是否与CD48形成二聚体,从而通过影响靶CD48的表达来发挥调控作用.最后检测lncRNA CD48-AS在细胞内的定位.结果 3-O-C12-HSL处理Mo-DCs后lncRNA表达谱出现了特异性改变.3-O-C12-HSL可下调由LPS诱导的Mo-DCs中lncRNA CD48-AS及其反义靶分子CD48的表达.生物信息学分析lncRNA CD48-AS不具备蛋白编码功能,为非编码RNA;lncRNA CD48-AS与CD48形成RNA二聚体从而减少RNA酶对CD48 mRNA的降解,使得CD48 mRNA表达增加;lncRNA CD48-AS在Mo-DCs中主要定位在细胞核中,细胞质中表达量较少.结论 3-O-C12-HSL可通过下调lncRNA CD48-AS,进而影响CD48的表达来阻碍Mo-DCs的成熟.
基金:
国家自然科学基金资助项目(81601736); 广东省中医药局中医药科研项目(20192027)
第一作者:
第一作者机构:
[1]广东省中医院检验医学部 501180
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
罗燕芬,庄奇真,张轩,等.3-O-C12-HSL通过抑制lncRNA CD48-AS和CD48的表达而阻碍Mo-DCs成熟[J].天津医药.2021,49(12):1233-1239.