目的 对集中空调系统中的弗朗西斯菌进行分离鉴定. 方法 收集2008—2014年广州市集中空调系统的324份冷却水和36份冷凝水水样,经负压膜过滤集菌、酸处理后接种军团菌选择性甘氨酸-万古霉素-多黏霉素B-放线菌酮( BCYEα-GVPC)培养基进行细菌分离培养,通过培养特征、生化反应特性等表型分析及弗朗西斯菌属特异性引物PCR鉴定、16S rRNA 基因序列分析、基因组DNA-DNA杂交等方法进行菌种鉴定. 结果 从14份集中空调冷却水中分离到15株菌,经表型分析和弗朗西斯菌属特异性引物PCR扩增确定为弗朗西斯菌,水样的阳性率分别为:冷却水4.3%,冷凝水0%. 15个分离菌株的16S rRNA 基因序列分析及系统发育分析显示,其可分为4个分支,包括为广州弗朗西斯菌9株,蜃楼弗朗西斯菌1株,另2个分支的5株菌与广州弗朗西斯菌亲缘关系最接近,但基因组DNA-DNA杂交证明与广州弗朗西斯菌同源性<70%,初步确定为弗朗西斯菌属内的候选新种. 结论 广州市集中空调系统水样弗朗西斯菌阳性率低,且未发现强致病性的土拉热弗朗西斯菌.