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RhD抗体ssDNA适配体结构分析

Structure analysis of RhD antibody ssDNA aptamer

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心

机构: [1]深圳市血液中心,广东深圳,518035 [2]陕西省血液中心 [3]广州中医药大学第二附属医院输血科
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关键词: RhD抗体 核酸适配体 克隆测序 同源性分析 结构分析 Rh血型

摘要:
目的 预测RhD抗体核酸适配体序列库中优势适配体,为实验室验证做准备.方法 对以RhD抗体为目标靶分子而筛选出的适配体序列库做克隆测序;使用Clustal Ⅹ软件对阳性克隆子序列做同源性分析;使用DNAfolding form在线分析工具对阳性克隆子碱基序列做最小自由能及二级结构分析.结果 RhD抗体28个阳性克隆子碱基序列按照基序的不同可分为3个家族,家族1和2中的适配体又可分为不同的亚家族;可形成由2-4个多分支环组成的二级结构,最小自由能在(-7.47--5.09)kcal/mol.结论 RhD家族1中的亚家族3和4适配体二级结构较为稳定,最小自由能较低,是RhD抗体适配体库中的优势适配体.

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第一作者:
第一作者机构: [1]深圳市血液中心,广东深圳,518035
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资源点击量:2018 今日访问量:0 总访问量:645 更新日期:2024-07-01 建议使用谷歌、火狐浏览器 常见问题

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