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◇ 统计源期刊
文章类型：
机构：
[1]广州医科大学附属第一医院检验科,广东广州510120
[2]广州医科大学附属第一医院转化医学研究实验室,广东广州510120
[3]广东省中医院,广东广州510105
广东省中医院
出处：
ISSN：
关键词：
16S rDNA
管家基因
不常见菌株
序列分析
摘要：
目的 建立细菌16S rDNA序列分析技术并探讨其在临床不常见细菌鉴定中的应用价值.方法 收集经全自动微生物分析系统鉴定其可靠率在99％及以上的常见细菌10株和常规方法难以鉴定或少见菌17株,通过PCR扩增16S rDNA v3-v4区基因片段并进行序列测定,序列与16SpathDB 2.0数据库上已知细菌的16S rDNA序列进行比对分析确定细菌种属.当v3-v4序列片段不能明确鉴定细菌时,结合16S rDNA长片段测序及管家基因dnaJ和rpoB的序列做进一步分析.结果 经16S rDNA v3-v4区序列分析,10株(100％)临床常见菌都能鉴定到种水平,其可靠性大于98.0％.17株不常见菌株中,10株(58.8％)细菌只与1种菌相似性大于98.0％,成功鉴定到单个种水平;6株(35.3％)细菌与不止1种菌的相似比大于98.0％;1株菌与已知菌相似性在96.0％～98.0％之间只能鉴定到属(棒状杆菌).进一步结合16S rDNA长片段及管家基因dnaJ和rpoB的序列分析,所有菌株均可鉴定到单个种水平.结论 结合16SrDNA和管家基因序列分析,可用于临床常见及不常见细菌的分子鉴定.
基金：
广东省临床重点专科建设项目(广州医科大学,2013)；
第一作者：
第一作者机构：
[1]广州医科大学附属第一医院检验科,广东广州510120
通讯作者：
推荐引用方式(GB/T 7714)：
宋金龙,林勇平,梁颖,等.16SrDNA序列分析在临床不常见细菌鉴定中的初步应用[J].热带医学杂志.2014,14(05):611-614+630.
