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卫生部微生物室间质评1012菌的鉴定与放线菌属的系统发生分析
Identification of the strain 1012 isolated from the sample of EQA of the Chinese National Center of Clinical Laboratory, and phylogenetic analysis of Actinomyces turicensisand related bacteria in the family Actinomycetaceae
20
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文献详情
资源类型:
期刊
收录情况:
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-C
◇ 中华系列
文章类型:
作者:
屈平华[1]
*
;
赵红波[2]
;
黄彬[3]
;
张伟铮[1]
;
张颖[4]
;
陈茶[1]
;
机构:
[1]广东省中医院检验科,510006
大德路总院
检验科
广东省中医院
[2]广州医学院第一附属医院海印分院呼吸病国家重点实验室
[3]中山大学附属第一医院检验科
中山大学附属第一医院
[4]广州市疾病预防控制中心微生物检验科
出处:
中华检验医学杂志.2011,34(9):814-819.
DOI:
10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2011.09.010
ISSN:
1009-9158
关键词:
放线菌科
RNA
核糖体
16S
序列分析
评价研究
摘要:
目的 对卫生部临床检验中心2010年微生物室间质评1012菌进行鉴定,研究1012菌的分类学位置及放线菌属的系统分类现状。方法采用传统的细菌学形态检查、商品化的API、以及16S rRNA基因测序等多种手段对1012菌进行系统的鉴定。结合远程计算机系统提供的原核生物信息,构建放线菌属及相关细菌的16S rRNA基因的系统发生树,研究放线菌属的系统进化及1012菌与相关菌种之间的亲缘关系。结果1012菌为兼性厌氧、不形成芽胞的革兰氏阳性棒状菌,60多项生化实验,除L-阿拉伯糖发酵实验阴性,其余与图列茨放线菌一致。16S rRNA基因序列分析结果显示:1012菌与图列茨放线菌的同源性高达99.8%,但与放线菌属的模式菌种——牛放线菌的同源性仅为90.6%。进一步的系统发生树亦表明,放线菌科的五个菌属清晰地聚类成9个“基因属”,小弯杆菌、动弯杆菌、放线杆菌、隐秘杆菌4个菌属分别包含单一的基因群,而放线菌属则包含了5个独立的基因群。结论1012菌可鉴定为图列放线菌,但从基因的角度上分析,当前的放线菌属的组成结构过于松散,可能会重新分类。
语种:
中文
第一作者:
屈平华
第一作者机构:
[1]广东省中医院检验科,510006
通讯作者:
陈茶
推荐引用方式(GB/T 7714):
屈平华,赵红波,黄彬,等.卫生部微生物室间质评1012菌的鉴定与放线菌属的系统发生分析[J].中华检验医学杂志.2011,34(9):814-819.
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