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基于网络药理学和分子对接分析达原饮治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的分子靶点和机制

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心

机构: [1]广州中医药大学第二临床医学院,广东广州510405 [2]广东省中医院,广东广州510405
出处:

关键词: 网络药理学 分子对接 达原饮 新型冠状病毒肺炎 分子靶点 机制

摘要:
目的:通过网络药理学分析和分子对接的方法,探究达原饮治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的分子靶点和机制,为中医药治疗COVID-19提供指导。方法:通过TCMSP和Drugbank数据库检索获取达原饮的有效中药成分和靶点。通过Gennecards和OMIM数据库以“novel coronavirus pneumonia”为关键词搜索获取新型冠状病毒肺炎的靶点。通过生物信息学与进化基因组学系统得到两者的共有靶点。通过cytoscape372构建达原饮治疗COVID-19分子靶点图。通过PPI蛋白互作网络结合cytoscaape372的cytoHubb插件构建靶点相关关系图,寻找富集数目最多的靶点。通过R语言对达原饮治疗COVID-19的靶点进行GO和KEGG富集分析,采用AutoDock42和PyMol进行核心成分和靶点对接以及可视化处理。结果:共得到达原饮有效中药成分166个,达原饮治疗新型冠状病毒肺炎主要中药成分83个,主要为来自草果、甘草的quercetin(槲皮素)、来自知母、白芍的kaempferol(山奈酚);达原饮靶点203个;新型冠状病毒肺炎靶点253个;达原饮治疗COVID-19靶点45个,主要核心靶点为IL6、MAPK8、CASP3、IL10、IL1B;达原饮治疗COVID-19涉及GO 75条,主要为cytokine receptor binding;达原饮治疗COVID-19的KEGG通路148条,主要为AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications。分子对接结果显示达原饮治疗COVID-19的重要化合物槲皮素与核心靶点IL6、MAPK8、CASP3、IL10、IL1B有良好的亲和力。结论:通过网络药理学和分子对接分析,探析了达原饮治疗COVID-19的分子靶点和机制,为中医药治疗COVID-19提供临床与基础指导。

语种:
第一作者:
第一作者机构: [1]广州中医药大学第二临床医学院,广东广州510405
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