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基于网络药理学和分子对接探讨真武汤治疗扩张型心肌病的作用机制

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机构: [1]广州中医药大学 [2]广州中医药大学第一附属医院 [3]广东省中医院
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关键词: 扩张型心肌病 真武汤 网络药理学 分子对接 作用机制

摘要:
目的 基于网络药理学和分子对接的方法探讨真武汤治疗扩张型心肌病的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Swiss Target Prediction网站获取真武汤有效化合物成分及相应的靶点,利用UniProt数据库将获得的靶点名称转换成基因名;通过在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、基因名片数据库(GeneCard)、TTD数据库、毒性与基因比较数据库(CTD)、遗传药理学和药物基因组学数据库(PharmGKB)获取扩张型心肌病相关基因,将真武汤靶点基因和扩张型心肌病相关基因取交集作为真武汤治疗扩张型心肌病的潜在靶点;将交集基因导入STRING数据库进行蛋白互作分析,利用Cytoscape软件绘制真武汤中药-潜在化合物-潜在靶点的可视化网络关系图;应用RStudio的ClusterProfiler包对潜在靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用Pathview包进行代谢途径整合和可视化;最后将筛选的关键靶蛋白进行分子对接验证。结果 通过筛选得到真武汤有效化合物成分59个,对应药物靶点259个,扩张型心肌病相关靶点980个,潜在靶点47个,筛选出41个与疾病相关的有效化合物,GO功能注释分析到943条,KEGG富集分析到120条信号通路。其中β-谷甾醇、山奈酚、3β-乙酰氧基苍术酮、去甲乌头碱、芍药新苷、多根乌头碱、茯苓酸B、常春藤皂苷元等为真武汤治疗扩张型心肌病的主要活性化合物,白细胞介素6(IL6)、肿瘤坏死因子(TNF)、转录激活因子3(STAT3)、表皮生长因子受体(EGFR)、内皮一氧化氮合酶(NOS3)等为关键靶点,主要通过调控晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、弓形虫、脂肪细胞脂解、肾素分泌、钙离子等信号通路发挥治疗作用。结论 真武汤可能通过β-谷甾醇、山奈酚、3β-乙酰氧基苍术酮、去甲乌头碱、芍药新苷等关键活性成分作用于IL6、TNF、STAT3、EGFR、NOS3等关键靶点,通过调节AGE-RAGE、HIF-1、弓形虫、脂肪细胞脂解、肾素分泌、钙离子等信号通路,产生抑制氧化应激及炎症、改善心肌能量代谢、调节免疫功能等机制发挥综合治疗作用。

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第一作者机构: [1]广州中医药大学
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