资源类型:
收录情况:
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-C
◇ 中华系列
文章类型:
机构:
[1]广州中医药大学第二临床医学院,广州510006
广东省中医院
[2]江门市五邑中医院检验科,江门 529000
[3]广东省中医院检验医学部,广州510006
大德路总院
检验科
大德路总院检验科
广东省中医院
[4]广州市番禺区健康管理中心,广州 511490
出处:
关键词:
海岸嗜半胱氨酸菌
分类鉴定
药敏
毒力基因
摘要:
目的通过对1株从1名被海虾刺伤的患者脓液分离的致病菌株JM-1进行准确鉴定、药敏试验和毒力基因分析, 为海岸嗜半胱氨酸菌(Cysteiniphilum litorale)作为罕见病原体引起临床相关感染的筛检及改善预后提供实验依据。方法对分离株进行生化表型鉴定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定、16S rRNA基因测序和系统发育分析, 以及基于全基因组序列的平均核苷酸一致性(average nucleotide identity, ANI)、平均氨基酸一致性(average amino acid identity, AAI)分析和系统发育分析, 以准确确定其分类学地位;以E-test法进行药敏试验, 并依据CLSI M45-A3土拉弗朗西斯菌解释标准进行结果判读;以VFDB毒力因子数据库对全基因组进行毒力基因注释和分析。结果分离株JM-1在哥伦比亚血平板上培养3 d可见灰白色、中等大小、光滑、圆形、凸起的溶血菌落。革兰染色为着色较淡的阴性球杆菌。API NH鉴定结果提示为卡他莫拉菌(生化编码:3010);Vitek2系统NH卡鉴定无鉴定结果(生物编码:0211002121)。EXS3000质谱仪自建库数据库鉴定为海岸嗜半胱氨酸菌。基于16S rRNA基因和全基因组的系统发育分析均表明该菌株与海岸嗜半胱氨酸菌DSM 101832T聚类为同一个小的分支, 且两者之间的全基因组ANI和AAI值分别为95.07%和95.65%。药敏试验显示分离株JM-1产β-内酰胺酶和青霉素酶, 对青霉素耐药, 对庆大霉素、链霉素、强力霉素、四环素、环丙沙星、左氧氟沙星、氯霉素敏感。从分离株JM-1基因组注释到了与弗朗西斯菌相似的毒力基因:弗朗西斯菌致病岛(FPI)、Ⅳ型菌毛、荚膜和脂多糖等。结论海岸嗜半胱氨酸菌是一种具有弗朗西斯菌毒力相关基因罕见病原体, 且其药敏特性亦与弗朗西斯菌相类似。本案例确认了一例由海岸嗜半胱氨酸菌引起的临床感染, 自建库的MALDI-TOF质谱系统可用于其快速鉴定。
基金:
广东省自然科学基金(2020A1515011119)
第一作者:
第一作者机构:
[1]广州中医药大学第二临床医学院,广州510006
通讯作者:
通讯机构:
[1]广州中医药大学第二临床医学院,广州510006
[3]广东省中医院检验医学部,广州510006
推荐引用方式(GB/T 7714):
冯俊慧,钟一梅,赵婵静,等.一株脓液分离的海岸嗜半胱氨酸菌的鉴定及毒力基因分析[J].中华微生物学和免疫学杂志.2022,42(4):258-264.