资源类型:
收录情况:
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-C
◇ 中华系列
文章类型:
机构:
[1]中山大学附属第一医院医学检验科
中山大学附属第一医院
[2]大阪大学微生物病研究所
[3]广东省中医院检验医学部
大德路总院
检验科
大德路总院检验科
广东省中医院
[4]南方医科大学附属第二医院(珠江医院)血液内科
南方医科大学珠江医院
[5]中山大学附属第一医院转化医学中心
中山大学附属第一医院
出处:
ISSN:
关键词:
抗药性
微生物
霍氏肠杆菌霍夫曼亚种
肠杆菌
阴沟
碳青霉烯酶
分子流行病学
摘要:
目的研究多重耐药霍氏肠杆菌霍夫曼亚种临床分离株C37携带blaNDM-1基因质粒的遗传特征, 并对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组进行系统发育分析, 以研究霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的全球流行情况。方法收集2014年8月至2021年8月中山大学附属第一医院分离的耐碳青霉烯阴沟肠杆菌复合物(CRECC)。采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)和16S rRNA Sanger测序对C37进行菌种鉴定。使用微量肉汤稀释法进行抗菌药物敏感性试验。采用聚合酶链反应(PCR)检测C37菌株携带的β内酰胺酶耐药基因和质粒介导的喹诺酮类耐药(PMQR)基因。使用接合试验确认C37菌株抗性基因的接合转移性。对C37菌株进行全基因组测序, 提取霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组, 对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种进行系统发育分析。结果霍氏肠杆菌霍夫曼亚种C37菌株对三代头孢、碳青霉烯类、氨基糖苷类及喹诺酮类抗菌药物耐药, 携带blaACT-5、blaNDM-1、qnrA1、aac(6′)-Ib-cr、oqxAB、fosA、dfrA15等多种抗性基因及IncX3、IncX4、IncFIB和IncFII质粒。多位点序列分型(MLST)分析显示其属于阴沟肠杆菌复合体(ECC)ST78型。系统发育分析显示ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关。结论 ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关, 是传播碳青霉烯耐药基因的高风险克隆, 需密切监测其流行情况。
基金:
国家自然科学基金(81772249, 81871703);广东省科技计划(2019A030317003);
第一作者:
第一作者机构:
[1]中山大学附属第一医院医学检验科
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
向国秀,马幸延,蔡依玫,等.霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的基因组流行病学分析[J].中华检验医学杂志.2022,45(09):943-949.