目的：确认PCR-序列特异性寡核苷酸探针（SSOP）法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果样本的HLA真实基因型。方法：对HLA高分辨组织配型血样采用PCR-SSOP法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果进一步采用PCR-直接测序分型（SBT）技术和二代测序（NGS）技术复检确认。结果：采用PCR-SSOP方法检出4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常的样本，加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示，样本1的HLA-A分型结果与已知基因型不完全匹配，NGS分析显示，该等位基因与同源性最接近的等位基因A*31:01:02:01在第2外显子154位G＞A变异，导致28位编码氨基酸由缬氨酸变为蛋氨酸（p.Val28Met），样本2的HLA-C结果为C*03:119, 06:02，样本3的HLA-C结果为C*03:03, 07:137，样本4的HLA-B结果为B*55:02,55:12。采用PCR-SSOP方法检出3例模棱两可结果样本，加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示，样本5的HLA-B结果为B*15:58, 38:02，样本6的HLA-DRB1结果为DRB1*04:05, 14:101，样本7的HLA-DQB1结果为DQB1*03:34,05:02。其中等位基因C*03:119、C*07:137和DRB1*14:101均未收录于中国造血干细胞捐献者资料库的常见及确认等位基因（CWD）表2.4版本。结论：PCR-SSOP法磁珠探针HLA基因分型结果格局异常提示可能为HLA罕见等位基因或新等位基因，需要测序验证。