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ITS基因测序分析对89株病原真菌鉴定的应用评价

Application and evaluation for sequencing analysis based on internal transcribed spacer gene for identification of 89 strains of pathogenic fungi

文献详情

资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-E

机构: [1]天津医科大学检验学院,天津 300070 [2]广东省中医院大学城医院检验科,广州510006 [3]卫生部北京医院,北京100730 [4]广州金城医学检验中心有限公司,广州510330 [5]广西中医药大学第一附属医院,南宁530023 [6]广州中医药大学第二临床医学院,广州510405
出处:
ISSN:

关键词: 真菌 内转录间隔区 菌种鉴定

摘要:
目的 探讨内转录间隔区(ITS)基因扩增测序技术在病原真菌鉴定中应用价值.方法 应用通用引物ITS1和ITS4对收集的89株真菌(包括酵母菌标准菌株6株,室间质评菌7株,临床分离的酵母样真菌42株和丝状真菌34株)进行PCR扩增和基因测序.测序成功的ITS序列在CBS数据库(http://www.cbs.knaw.nl/Collections)进行序列比对,结合Mycobank(http://cn.mycobank.org/)分类信息以获得其菌种鉴定信息.结果 89株不同种类的真菌均成功扩增到ITS靶基因,经测序,89株真菌均获得扩增的全序列.序列比对结果显示,6株酵母菌标准株中,5株鉴定到种,1株鉴定到属;7株室间质评株中,1株酵母菌鉴定到种,6株丝状真菌中2株鉴定到种,1株鉴定到属,3株鉴定到复合群;42株临床分离的酵母样真菌中,39株鉴定到种,3株鉴定到属;34株临床分离的丝状真菌中,10株鉴定到种,18株鉴定到属,6株鉴定为复合群.结论 通用引物ITS1和ITS4广谱性强.ITS基因序列扩增和测序分析可快速、有效鉴定临床疑难真菌,但仍存在数据分析过程烦琐和结果解释困难的问题.

语种:
第一作者:
第一作者机构: [1]天津医科大学检验学院,天津 300070
通讯作者:
通讯机构: [1]天津医科大学检验学院,天津 300070 [4]广州金城医学检验中心有限公司,广州510330
推荐引用方式(GB/T 7714):

资源点击量:2018 今日访问量:0 总访问量:645 更新日期:2024-07-01 建议使用谷歌、火狐浏览器 常见问题

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