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◇ 统计源期刊
文章类型:
机构:
[1]广州中医药大学第二附属医院 广东省中医院急诊科,广东广州510120
大德路总院
急诊科
广东省中医院
[2]广东省中医急症重点实验室
出处:
ISSN:
关键词:
扶正救肺方
网络药理学
新冠肺炎
新冠病毒
急性肺损伤
分子对接
甘草查尔酮A
木犀草素
漆黄素
摘要:
目的通过网络药理学和分子对接法探讨扶正救肺方治疗新冠肺炎的作用机制。方法基于TCMSP筛选扶正救肺方的有效成分及搜集靶点基因,通过GeneCards、OMIM、Drugbank数据库获得新冠肺炎靶点,利用R语言匹配成分靶点和疾病靶点,视为扶正救肺方治疗新冠肺炎的潜在靶点。利用Cytosacpe3.6.0软件构建成分-靶点网络,基于STRING建立蛋白相互作用(Protein-Protein interaction,PPI)网络,对网络进行拓扑结构分析,筛选出排名靠前的有效成分和靶点基因。利用R语言的ClusterProfile对潜在靶点做基因本体(GO)分析和KEGG富集分析。利用分子对接法分析有效成分和新冠病毒M蛋白的相互作用关系。结果网络拓扑结构分析显示,共有165个节点(116个化学成分和49个靶点)、603条边,其中包括槲皮素、木犀草素、漆黄素等活性成分47个,主要作用靶点IL6、MAPK1、MAPK8、CASP3、IL1B等。GO分析显示潜在靶点与氧化应激、细胞凋亡、细胞因子活性等多个生物学过程相关。KEGG富集分析得到20条信号通路(P (0.05),主要有晚期糖基化终产物信号通路、卡波氏肉瘤相关疱疹病毒感染通路、人类巨细胞病毒感染通路、肿瘤坏死因子通路等。甘草查尔酮A(-6.01 kcal/mol)、木犀草素(-5.54 kcal/mol)、漆黄素(-5.51 kcal/mol)与新冠病毒M蛋白的结合能最低。结论推测扶正救肺方通过抗病毒、抗炎、调节免疫等机制治疗新冠肺炎,调节新冠病毒M蛋白是其发挥作用的途径之一。
基金:
广东省重点研发计划项目(2020B1111300005)
第一作者:
第一作者机构:
[1]广州中医药大学第二附属医院 广东省中医院急诊科,广东广州510120
通讯作者:
通讯机构:
[1]广州中医药大学第二附属医院 广东省中医院急诊科,广东广州510120
[2]广东省中医急症重点实验室
推荐引用方式(GB/T 7714):
李国炜,黎永琳,刘云涛,等.基于网络药理学和分子对接法探讨扶正救肺方治疗新冠肺炎的可能机制[J].中国国境卫生检疫杂志.2021,44(05):311-318.