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◇ 中华系列
文章类型:
机构:
[1]广州中医药大学第二临床医学院,广州 510006
广东省中医院
[2]东莞康华医院心外科,东莞 523000
[3]东莞康华医院检验科,东莞 523000
[4]广州中医药大学第二临床医学院/广东省中医院检验医学部,广州 510006
大德路总院
检验科
大德路总院检验科
广东省中医院
出处:
ISSN:
关键词:
螺原体
基因组学
系统发育分析
摘要:
目的:对一株自脓毒血症患者血液中分离的罕见螺原体DGKH1进行菌种鉴定和生物学特性分析。方法:对DGKH1进行常规细菌培养、染色与形态学观察、生理生化鉴定、16S rRNA基因测序和系统发育分析,以及基因组测序和基因组相关指数分析,从而确定其分类学地位;参考人型副支原体和解脲脲原体进行药敏试验。结果:分离株DGKH1可以在哥伦比亚血平板、巧克力平板和嗜血巧克力平板上微弱生长,在含有四环素(4 μg/ml)、多西环素(1 μg/ml)、米诺环素(1 μg/ml)、交沙霉素(2 μg/ml)、罗红霉素(1 μg/ml)、克拉霉素(1 μg/ml)和特利霉素(1 μg/ml)的支原体液体培养基中不生长。在商品化的支原体固体培养基上,DGKH1可形成"油煎蛋样菌落",与人型副支原体相类似。采用常规革兰染色,DGKH1不着色;以磷酸盐缓冲液为基质进行透射电镜观察,其菌体呈螺旋形。16S rRNA基因测序显示,分离株与中华绒螯蟹螺原体CCTCC M 207170
T相似性最高(99.85%),但尿素分解试验阳性,与已知螺原体属菌种存在差异。全基因组系统发育分析显示,该菌株与中华绒螯蟹螺原体CCTCC M 207170
T聚类为同一个小的分支,但两者之间的全基因组平均核苷酸一致性(ANI)和数字DNA-DNA杂交(dDDH)值分别为94.14%和56.00%,均低于原核生物的种鉴定阈值。
结论:分离株DGKH1隶属于螺原体属,是一种与中华绒螯蟹螺原体亲缘关系密切的潜在新种,其部分微生物学特性与支原体相类似,但自然宿主来源和流行病学资料还有待于更深入研究。
基金:
国家科技部基础资源调查专项基金(2021FY100900)
第一作者:
第一作者机构:
[1]广州中医药大学第二临床医学院,广州 510006
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
杨超,陈燕,李顺光,等.一株脓毒血症患者血液分离的罕见螺原体鉴定和生物学特性分析[J].中华微生物学和免疫学杂志.2023,43(8):574-581.