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21种广东省珍稀保护药用植物的DNA条形码分析

DNA Barcode Analysis of 21 Rare and Protected Medicinal Plants in Guangdong Province

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-C

机构: [1]广州中医药大学第二附属医院,广东 广州,510120
出处:
ISSN:

关键词: 珍稀保护药用植物 物种鉴定 DNA条形码

摘要:
目的 研究广东省珍稀濒危药用植物和国家重点保护药用植物的DNA条形码,构建条形码数据库,为广东省珍稀保护药用植物分子鉴定提供依据.方法 野外采集目标植物叶片,硅胶干燥保存.采取试剂盒法提取样品基因组DNA,扩增ITS2、psbA-trnH、ITS、matK、rbcL、ycf1等6种DNA条形码,Sanger法进行双向测序.对双向拼接后的序列进行测序成功率、序列特征和BLAST鉴定情况统计.结果 共搜集广东省珍稀保护药用植物21种182份,经测序获得条形码543条,各条形码在全部样品中的测序成功率比较:psbA-trnH>rbcL>ITS2>matK>ycf1>ITS,在物种水平的BLAST鉴定成功率比较:psbA-trnH>ITS>ycf1>matK>ITS2>rbcL.同时统计各条形码在蕨类、裸子及被子植物等不同分类阶元中的相应数据.结论 综合测序成功率和BLAST鉴定成功率的结果,psbA-trnH条形码表现最好,为最适用于鉴定广东省珍稀保护药用植物的DNA条形码.同时,该研究构建了广东省珍稀保护药用植物DNA条形码数据库,为这些物种的分子鉴定奠定基础.

基金:

基金编号: 2016A020226045

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第一作者:
第一作者机构: [1]广州中医药大学第二附属医院,广东 广州,510120
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):

资源点击量:2018 今日访问量:0 总访问量:645 更新日期:2024-07-01 建议使用谷歌、火狐浏览器 常见问题

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