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miR-122启动子rs7227488单核苷酸多态性及其对HCV易感性研究

Single nucleotide polymorphism (rs7227488)in the promoter of miR-122 affect the promoter activity and contribute to the differences in the susceptibility to hepatitis C virus

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心

机构: [1]广州中医药大学第二附属医院输血科,广东广州,510120 [2]南方医科大学南方医院
出处:
ISSN:

关键词: 微小RNA miR-122 丙型肝炎病毒 单核苷酸多态性 启动子 易感性

摘要:
目的 了解miR-122启动子单核苷酸多态(SNP) (rs7227488)对启动子活性的影响及其不同基因型对丙型肝炎病毒(HCV)易感性造成的差异.方法 采集来本院做HCV感染情况检查患者的血液标本,利用实时荧光定量PCR和ELISA方法检测其HCV感染情况,HCV-RNA和抗-HCV均为阳性者纳入HCV阳性组,HCV-RNA和抗-HCV均为阴性者纳入HCV阴性组;利用高分辨率熔解曲线分型技术检测rs7227488各基因型在HCV阳性组和阴性组中的频率分布.分别构建含rs7227488 A和G等位基因型的miR-122启动子驱动的萤光素酶报告基因载体,利用双萤光素酶报告基因系统检测2种启动子活性差异.结果 在所检测的患者中,171名被纳入HCV阳性组,125名被纳入阴性组.HCV阳性组和阴性组中的AA基因型频率分别为23.98%(41/171) vs 12.80% (16/125)(P<0.05,OR=2.149)、AG基因型频率分别为14.04%(24/171) vs 29.60%(37/125)(P<O.05,OR=0.388)、GG基因型频率分别为61.99%(106/171)vs 57.6%(72/125) (P>0.05).在肝癌细胞株QGY中,G等位基因型的miR-122启动子活性是A等位基因型的miR-122启动子活性的1.7倍(P<0.05);在另一肝癌细胞株7721中,G等位基因型的miR-122启动子活性是A等位基因型的miR-122启动子活性的1.4倍(P<0.05).结论 rs7227488 A等位基因型可影响miR-122的启动子活性,不同rs7227488基因型在HCV阳性者和阴性者中的分布频率不同,推测AA基因型可能增加HCV感染风险,而AG型则可能降低HCV感染风险.

基金:

基金编号: 2016A020215142,2014A020212641

语种:
第一作者:
第一作者机构: [1]广州中医药大学第二附属医院输血科,广东广州,510120
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):

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